次世代シーケンス解析ソフトウェア GENETYX NGS Ver.1 / GENETYX NGS - MAC Ver.1 は、
次世代シーケンサーのデータを解析するソフトウェアです。
リファレンス配列へのマッピング、De novo Assembly 、クオリティチェック、トリミング、
発現量解析など多岐にわたる解析内容をご利用いただけます。
■ De novo Assembly 機能
次世代シーケンス解析ソフトウェア
■ マッピング機能
GENETYX
NGS
Ver.1
/ Windows
版
■ 動作環境（ Macintosh 版）
■
動作環境（ Macintosh 版）
● De novo Assembly ( MIRA または Forge )
●
トリミング検索
●
解析履歴機能
●
クオリティチェック機能
取 扱 店
＊会社名・製品名は各社の商標または登録商標です。 ＊記載事項は機能改良のため予告なく変更することがあります。
CATALOGUE:180319
GENETYX URL http://www.genetyx.co.jp/
TEL 03(3406)3241(大代表) FAX 03(3406)4881
TEL 06(6304)2371(大代表） FAX 06(6304)1086 東京都渋谷区渋谷3丁目8番12号
E-mail:[email protected]
大阪市淀川区西中島6丁目7番8号 E-mail:[email protected] 本 社 〒150-0002
大阪支店 〒532-0011
：macOS Sierra v10.12 以上が動作する IntelMac シリーズ ：macOS Sierra v10.12 以上
：8GB 以上（ 16GB 以上推奨）
：1GB 以上の空き容量 HFS+ でフォーマットした HDD （購入時は HFS+ でフォーマットされています。 その他のフォーマットでは動作致しません。） ：光学ドライブ （インストール時に利用します。）
：本製品のご使用にはインターネットによるライセンス認証が必要 対応機種
対応 OS メモリ HDD 容量
その他 対応機種 対応 OS メモリ HDD 容量
その他
MIRA または Forge を使用した De novo Assembly を行います。
● トリミング機能
ファイルから入力した配列に対してトリミング処理を行い新しいファイルに出力します。
トリミングには以下のような処理があります。
・ アダプター（パターン指定）配列切除 ・ poly-A(T) tail 切除
・ クオリティ閾値配列切除 ・ ベース数指定配列切除
また、条件を指定して配列を取り除く処理も行います。
配列除去には以下のような処理があります。 ・ あいまいなベースを含む配列の除去 ・ 長さ制限による配列の除去
マッピングやアセンブルなどの解析を行う前にシーケンサーから出力されたデータの質を 調査します。
調査の対象は「クオリティ スコア」「各塩基の割合」「配列長」「重複度」等です。
解析結果は HTML 形式でファイルに保存して Web ブラウザ等で閲覧することができます。
● 解析履歴機能
解析実行時にパラメータを記憶、後から過去の解析パラメータを呼び出して解析を再現 することができます。
解析パラメータは各解析のダイアログに設定されるので、解析を実行する前に変更する ことも可能です。
● クオリティチェック機能
● マッピング
多数の断片配列を既知の配列上の類似度の高い部位へ配置します。
●
配列組成機能
任意の範囲を指定して、マッピングされたセグメント配列の組成を解析します。 解析結果は表として出力され CSV ファイルとして保存することができます。
● 配列組成機能
●
発現量機能
マッピングの結果を元に発現量解析を行います。
参照配列のアノテーション情報を GTF ( GFF ) ファイルから入力します。
※ Windows 版はカウントのみの表示
● 発現量解析機能
■ 動作環境（ Windows 版）
■
動作環境（ Windows 版）
：Microsoft Windows 10 / 8.1 / 7 が動作する機種 ：Microsoft Windows 10 / 8.1 / 7
※以上全て日本語版、64bit OS ：8GB 以上（ 16GB 以上推奨） ：1GB 以上の空き容量
：Internet Explorer Ver.11 以上がインスト－ルされていること ：本製品のご使用にはインターネットによるライセンス認証が必要 対応機種
対応 OS
メモリ HDD 容量 その他 対応機種 対応 OS
